Mis à jour le 29 septembre 2026 · chiffres vérifiés sur les sites officiels
En arrêt maladie, un auto-entrepreneur touche des indemnités journalières (IJ) de l’Assurance maladie s’il est affilié depuis au moins 12 mois et si son revenu moyen dépasse 4 582 € par an. L’IJ est égale à 1/730e de ton revenu annuel moyen des trois dernières années, dans la limite de 65,84 € brut par jour en 2026, après 3 jours de carence. Avec un petit chiffre d’affaires, l’indemnité est faible, voire nulle : c’est pour ça que la prévoyance compte.
En bref
- Conditions : 12 mois d’affiliation continue, un arrêt prescrit, et un revenu annuel moyen d’au moins 4 582 € (arrêts de 2026).
- Calcul : 1/730e du revenu annuel moyen des 3 dernières années civiles, soit le chiffre d’affaires après abattement.
- Plafond 2026 : 65,84 € brut par jour pour les artisans, commerçants et libéraux non réglementés.
- Carence : 3 jours, sauf exceptions (ALD, prolongation rapide, interruption spontanée de grossesse).
- Maternité : allocation forfaitaire de 4 005 € + IJ forfaitaires jusqu’à 65,84 € par jour, à condition d’arrêter au moins 8 semaines.
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Arrêt maladie auto-entrepreneur : qui a droit aux indemnités ?
Depuis 2018-2019, les auto-entrepreneurs (le nom courant du micro-entrepreneur) relèvent de l’Assurance maladie comme les salariés, avec des règles propres aux indépendants. Il faut d’abord savoir de quel régime d’indemnisation tu dépends :
| Ton activité | Régime des IJ | IJ maximale 2026 |
|---|---|---|
| Vente, prestations commerciales ou artisanales | Artisans et commerçants | 65,84 € brut |
| Libéral non réglementé (SSI) : rédaction, graphisme, conseil… | Même régime que les artisans et commerçants | 65,84 € brut |
| Libéral réglementé (CIPAV) | Professions libérales | 197,51 € brut, 90 jours maximum |
[legende] Source : ameli.fr, pages « arrêt maladie des artisans et commerçants » et « arrêt maladie des professions libérales ».
La plupart des activités de chez soi (assistante indépendante, rédacteur web, graphiste, couturière) sont dans le premier cas. Pour vérifier ton taux et ta catégorie, voir les cotisations de l’auto-entrepreneur.
Les conditions
Selon ameli.fr, pour un artisan, un commerçant ou un micro-entrepreneur de ce régime :
- 12 mois d’affiliation continue en tant qu’indépendant à la date de l’arrêt.
- Un arrêt de travail prescrit par un médecin, envoyé à ta caisse dans les 48 heures.
- Un revenu annuel moyen (RAAM) d’au moins 4 582 € sur les trois dernières années civiles (10 % de la moyenne du PASS). En dessous, aucune IJ n’est versée.
- L’arrêt de toute activité pendant l’arrêt : tu ne peux pas continuer à facturer.
Le calcul des indemnités journalières
La formule
IJ = revenu annuel moyen des 3 dernières années civiles ÷ 730
Pour un micro-entrepreneur, le revenu retenu n’est pas le chiffre d’affaires brut mais le chiffre d’affaires après abattement forfaitaire :
| Activité | Abattement | CA minimum pour toucher des IJ |
|---|---|---|
| Vente de marchandises | 71 % | environ 15 800 € par an |
| Prestations de services BIC | 50 % | environ 9 164 € par an |
| Libéral BNC | 34 % | environ 6 942 € par an |
[legende] CA annuel moyen nécessaire pour atteindre un revenu de 4 582 € après abattement. Calcul du site à partir des chiffres ameli.fr 2026.
Trois exemples
- Une couturière (services BIC) avec 30 000 € de CA par an en moyenne : revenu 15 000 € ; IJ = 15 000 ÷ 730 = 20,55 € brut par jour.
- Un rédacteur web (libéral BNC) avec 20 000 € de CA : revenu 13 200 € ; IJ = 13 200 ÷ 730 = 18,08 € brut par jour.
- Une vendeuse en ligne avec 40 000 € de CA : revenu 11 600 € ; IJ = 11 600 ÷ 730 = 15,89 € brut par jour.
Pour atteindre l’IJ maximale de 65,84 €, il faut un revenu moyen égal au PASS (48 060 €), ce qui est hors de portée d’une micro-entreprise de services (plafond de CA 83 600 €, soit 41 800 € de revenu après abattement de 50 %). En pratique, les IJ d’un auto-entrepreneur couvrent rarement son manque à gagner.
Le délai de carence
Les IJ sont versées à partir du 4e jour d’arrêt : les 3 premiers jours ne sont pas indemnisés. Selon ameli.fr, la carence ne s’applique pas :
- en cas de prolongation d’un arrêt après une reprise de 48 heures au plus ;
- pour une affection de longue durée (ALD) ;
- en cas d’interruption spontanée de grossesse.
Pendant l’arrêt : cotisations et déclarations
Tes cotisations sont calculées sur le chiffre d’affaires encaissé : si tu n’encaisses rien pendant ton arrêt, tu ne paies rien sur cette période. Mais tu dois continuer à déclarer ton chiffre d’affaires, même à zéro, à chaque échéance : voir déclarer son chiffre d’affaires à l’URSSAF. Les IJ ne sont pas du chiffre d’affaires : ne les déclare pas à l’URSSAF.
Congé maternité auto-entrepreneur : les montants 2026
Les travailleuses indépendantes, micro-entrepreneuses comprises, ont droit à deux prestations cumulables, à condition d’avoir 6 mois d’affiliation à la date prévue de l’accouchement :
| Prestation | Montant 2026 | Si revenu moyen < 4 582 € |
|---|---|---|
| Allocation forfaitaire de repos maternel | 4 005 €, versés pour moitié au début du congé et pour moitié à la fin des 8 semaines obligatoires | 400,50 € |
| Indemnités journalières forfaitaires | jusqu’à 65,84 € par jour | 6,584 € par jour |
[legende] Source : ameli.fr, « Les prestations maternité des travailleuses indépendantes », montants au 1er janvier 2026.
La condition à ne pas rater : pour toucher les IJ, tu dois cesser toute activité au moins 8 semaines, dont 6 après l’accouchement. Au-delà, la durée indemnisable dépend du rang de l’enfant : Moneyvox indique 16 semaines pour un premier ou deuxième enfant et 26 semaines à partir du troisième. Fais confirmer ta durée par ta caisse.
Et les faibles revenus ?
Avec un revenu moyen inférieur à 4 582 € sur trois ans, les deux prestations tombent à 10 % du montant normal. C’est le cas de nombreuses micro-entrepreneuses qui démarrent. Si tu prépares une grossesse, regarde ton chiffre d’affaires des trois dernières années civiles.
Congé paternité
Le second parent indépendant touche une IJ forfaitaire de 65,84 € par jour en 2026, réduite à 10 % si son revenu moyen est inférieur à 4 582 €, avec 6 mois d’affiliation et l’engagement d’arrêter toute activité (ameli.fr). La durée du congé paternité est de 25 jours, 32 en cas de naissances multiples.
Le nouveau congé supplémentaire de naissance
Depuis le 1er juillet 2026, un congé supplémentaire de naissance d’un ou deux mois s’ajoute, pour les enfants nés ou adoptés à partir du 1er janvier 2026. Les indépendants y ont droit. Selon ameli.fr, l’indemnité est de 43 € net par jour le premier mois et 36,85 € net le second si ton revenu moyen atteint 4 582 €, et de 6,14 € net par jour en dessous.
La prévoyance : combler le trou
Avec des IJ de 15 à 20 € par jour et trois jours de carence, un arrêt de plusieurs semaines peut vite peser. Une prévoyance (contrat privé pour indépendants) peut verser des indemnités complémentaires, parfois dès le premier jour, et couvrir l’invalidité. Avant de signer, compare le délai de franchise, le montant garanti par jour et les exclusions (certaines pathologies, dos, psychique). Notre guide mutuelle et prévoyance de l’auto-entrepreneur détaille les critères.
Autre bon réflexe : garder une épargne de précaution de deux à trois mois de dépenses, et un revenu mieux étalé grâce à plusieurs clients. Pour organiser ton activité de chez toi, voir bien s’organiser pour travailler chez soi.
Les démarches en cas d’arrêt
- Consulte un médecin : il établit l’arrêt, en ligne ou sur le formulaire sécurisé.
- Envoie les volets 1 et 2 à ta CPAM sous 48 heures (le volet 3 est pour toi, tu n’as pas d’employeur).
- Arrête toute activité pendant l’arrêt.
- Déclare ton chiffre d’affaires à l’URSSAF à chaque échéance, même à zéro.
- Préviens tes clients et reporte les échéances.
Questions fréquentes
Un auto-entrepreneur a-t-il droit à un arrêt maladie ?
Oui, s’il est affilié depuis 12 mois et si son revenu annuel moyen dépasse 4 582 € (arrêts de 2026). L’IJ est égale à 1/730e de ce revenu, dans la limite de 65,84 € brut par jour.
Combien touche un auto-entrepreneur en arrêt maladie ?
Cela dépend de ton chiffre d’affaires des trois dernières années. Pour 30 000 € de CA par an en prestations de services, l’IJ est d’environ 20,55 € brut par jour.
Quel est le délai de carence d’un auto-entrepreneur ?
3 jours. Les IJ sont versées à partir du 4e jour, sauf exceptions (ALD, prolongation après une courte reprise, interruption spontanée de grossesse).
Combien touche une auto-entrepreneuse en congé maternité ?
En 2026 : une allocation forfaitaire de 4 005 € et des IJ forfaitaires jusqu’à 65,84 € par jour, si son revenu moyen dépasse 4 582 €. En dessous, 10 % de ces montants.
Peut-on travailler pendant un arrêt maladie en auto-entrepreneur ?
Non. Les IJ supposent l’arrêt de toute activité professionnelle. Facturer pendant l’arrêt t’expose à devoir rembourser les indemnités.
Sources
